Подготовку экономистов-кибернетиков Донецкий национальный университет начал в 1965 году. Первая группа специалистов была выпущена кафедрой экономической кибернетики в 1970 году по специальности «Экономическая кибернетика».
Кафедра экономической кибернетики была создана в сентябре 1968 года с момента перехода специальности с математического на экономический факультет университета. Заведующим кафедрой была кандидат экономических наук, доцент Москаленко М.П. – представитель Новосибирской школы экономической кибернетики. В начале 70-х годов заведующим кафедрой стал кандидат экономических наук, Амитан В. Н. - один из разработчиков первой АСУ Донецкого машиностроительного завода имени Ленинского комсомола Украины.
В 1976 году кафедра экономической кибернетики была включена в ряд других кафедр, которые сформировали учетно-финансовый факультет. Одной из важнейших задач работы кафедры, начиная с 1977 года, когда ее возглавлял доцент Поляков П.И., стала научная подготовка преподавателей. В 1983 году кафедра экономической кибернетики стала одной из ведущих кафедр, сформировавших экономико-правовой факультет. С 1991 по 1993 год кафедру возглавлял кандидат экономических наук, доцент Томаковский А.С., сконцентрировавший основные усилия на укреплении материальной базы кафедры, оснащении лабораторий и других подразделений кафедры новыми персональными компьютерами.
С 1993 по 2015 год кафедрой руководит доктор экономических наук, профессор, член-корреспондент НАН Украины, заслуженный профессор Донецкого национального университета Юрий Григорьевич Лысенко.
Лысенко Ю.Г. определил основные приоритеты развития специальности и кафедры, среди которых повышение квалификационного уровня экономистов-кибернетиков, расширение набора студентов (в том числе за счет открытия учебно-консультационных центров в Алуште и Мариуполе), постоянное обновление материальной базы, установление реальных творческих отношений с другими вузами и промышленными предприятиями, подготовка научно-педагогических кадров через аспирантуру и докторантуру.
С 2002 года кафедра осуществляет подготовку специалистов по специальности «Экономическая кибернетика» образовательного уровня магистр.
С 30.08.2013 года кафедра экономической кибернетики выведена из состава экономико-правового факультета и вошла в состав Учебно-научного института «Экономическая кибернетика».
С 2015 года руководство кафедрой осуществляет доктор экономических наук, профессор Тимохин Владимир Николаевич.
Первый набор бакалавров по направлению подготовки 38.03.05 «Бизнес-информатика» и магистров по направлению 38.04.05 «Бизнес-информатика» был осуществлен в 2015 году.
С 2016 года начат набор студентов на направление подготовки 38.03.01 Экономика (профиль: математические методы в экономике). В 2020 году планируется первый выпуск бакалавров по данному направлению подготовки.
Среди основных научных направлений, получивших развитие на кафедре, можно выделить работы, посвященные:
- методологии моделирования экономической динамики;
- моделированию различных аспектов деятельности крупных промышленных предприятий, в том числе управлению персоналом, маркетингом, логистикой, экономической безопасностью;
- методам и моделям управления проектами и проектному менеджменту;
- налоговому менеджменту и моделированию процессов налогообложения на региональном уровне и на уровне предприятий;
- созданию информационных систем, в том числе информационно-аналитических, систем управления финансами высшего учебного заведения.
Кафедра инициировала издание цикла монографий под общим названием «Жизнеспособные системы в экономике», предназначенных для руководителей с инновационными идеями, которые хотят активно применять на практике передовые методы управления. Было опубликовано 18 монографий данного цикла, среди которых наиболее значимые «Методология моделирования жизнеспособных систем» и «Методология управления слабыми сигналами».
Кафедра экономической кибернетики способствует развитию специальности «Информационная деятельность предприятия» в техникумах и колледжах региона. Так, при активной методической и организационной помощи кафедры эта специальность была открыта в Донецком техникуме промышленной автоматики. Эту работу планируется продолжить и в техникумах других городов.
Ведется работа по заключению договоров о трудоустройстве выпускников, в рамках которой поддерживаются связи со многими предприятиями региона, с целью реализации более эффективных механизмов экспертно-аналитических систем, а также с научно-исследовательскими институтами в области информационно-аналитического обеспечения фундаментальных исследований в управлении развитием социально-экономических систем.
Для привлечения к научно-исследовательской работе и отбора творческой одаренной молодежи, кафедрой ежегодно проводятся студенческие олимпиады и научные конференции.